CSSD (Central Sterile Supply Department) RSUD Atambua merupakan bagian yang mengurus suplai dan peralatan bersih atau steril. CSSD (Central Sterile Supply Department) RSUD Atambua memberikan pelayanan berupa suplai peralatan bersih atau steril dimana CSSD melayani suplai barang bersih dan steril yang digunakan di rumah sakit secara terpusat dan Pembersihan, penyiapan, pemrosesan, sterilisasi, penyimpanan, serta distribusi ke pasien agar dapat melaksanakan tugas dan fungsi sterilisasi, maka unit CSSD / pusat sterilisasi sangat membutuhkan kerja sama dengan unit penunjang yang lain seperti unsur pelayanan medik, unsur penunjang medik maupun instalasi antara lain perlengkapan, rumah tangga, pemeliharaan saranan rumah sakit, sanitasi, dan sebagainya.